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白天小睡协会频率和精神分裂症:双向两个示例孟德尔随机化研究

文摘

背景

双向因果白天小睡频率和精神分裂症之间的联系还不清楚。

方法

双向两个示例孟德尔随机化(MR)进行了分析与总结统计上的遗传变异与白天小睡频率从全基因组关联研究(GWAS)和精神分裂症。的单核苷酸多态性(snp)数据频率GWAS来自英国生物库(白天小睡n= 452633)和23 andme队列研究(n= 541333),而精神分裂症GWAS来自精神基因组联盟(包括36989例和113075控制)。方差倒数加权(IVW)分析的主要方法,加权平均,MR-Robust剖面调整分数(罪行),径向先生和MR-Pleiotropy余量和离群值(PRESSO)敏感性分析。

结果

先生分析了双向因果关系更频繁的日间小睡和精神分裂症的发生,与优势比打盹(或)增加1个单位类别(永远,有时,通常)精神分裂症为3.38(95%可信区间[CI]: 2.02 - -5.65,P= 3.58×106),β为精神分裂症的发生在白天打盹频率为0.0112(95%置信区间:0.0060—-0.0163,P= 2.04×105)。灵敏度分析得到相同的结论。

结论

我们的研究结果支持双向因果白天小睡频率和精神分裂症之间的联系,这意味着白天小睡频率是一个潜在的干预的进展和治疗精神分裂症。

同行评审报告

背景

精神分裂症是一个复杂的和虚弱的精神障碍1),被认为是世界上最严重的和禁用疾病之一(2),症状通常出现在青春期或成年早期(3]。全球大约有2100万人患有精神分裂症(3]。精神分裂症的终生患病率大约是1%4),最详细的收益率普遍在芬兰进行的研究结果为0.87%,但变化是世界各地的五倍5]。精神分裂症的特征是“阳性症状”的幻觉,妄想,和语言混乱,“阴性症状”的动机和表达能力,减少和认知赤字涉及执行功能受损,内存,和精神处理速度(6]。

白天午睡是一种跨文化现象发生在人类生活(7),尤其是在地中海的国家文化和一些non-Mediterranean国家,如美国(8]。白天小睡可以减少疲劳9),增强情绪处理(9),便于长期记忆的形成(10),提高主观和行为的措施,以及情绪和主观嗜睡水平(7),这似乎是一个有益的干预促进经济复苏和减轻负面的身体和认知的影响睡眠剥夺(11]。白天小睡的大约40分钟可以改善精神分裂症患者的陈述性记忆性能12]。

然而,频繁的疏忽与一系列的不良结果相关,包括高血压(13),血管疾病(14)、抑郁障碍(15),和糖尿病(16精神疾病(),特别是认知下降9]。更长的白天小睡通常是与更重要的认知能力下降,老年人的认知障碍的风险更高(17]。睡眠已被确定为一个过程跟大脑中的信息,和认知功能障碍是一种常见的特性在精神分裂症患者12]。由迈克尔•温伯格et al。这项研究显示在白天小睡频率显著增加精神分裂症患者(18],但白天小睡频率和精神分裂症之间的双向因果关系尚不清楚。更频繁的日间小睡和精神分裂症之间的双向因果关系可能是偏见由于可能的混杂因素,难以确认的观察性流行病学方法,如睡眠时间,失眠,白天嗜睡和起床时间。

孟德尔随机化(MR)是一种统计方法,它使用遗传变异,即。,single nucleotide polymorphisms (SNPs), as instrumental variables (IVs) to control confounding factors [19]。先生依赖于随机的遗传变异在减数分裂过程中,导致遗传变异的随机分布的人口(20.]。先生可以克服的混杂因素的影响,具有优越的优势面对因果推论的exposure-outcome由于基因型决定出生之前(21]。先生使用摘要统计信息从全基因组关联研究(GWAS)大量的遗传变异中提取单核苷酸多态性与曝光和结果变量,从而进一步揭示清楚暴露和结果之间的因果关系(22]。因此,本研究旨在推断更频繁的日间小睡和精神分裂症之间的双向因果关系,利用两个示例先生提供更可靠的证据。

方法

研究设计

先生的方法是基于三个主要假设(无花果。1)。首先,作为静脉注射与接触紧密相关的遗传变异(假设1)。其次,是独立的遗传变异的混杂因素(假设2)。第三,水平基因多效性应该避免(假设3)。水平基因多效性意味着遗传变异影响多个特征通过独立通路,外面发生在基因变异影响结果的影响暴露在孟德尔随机化22]。

图1
图1

孟德尔随机化辅助变量的假设

基因关联与白天小睡的频率

白天小睡频率的全基因组关联研究摘要统计信息来自英国生物库(n= 452,633),复制和验证在23 andme队列(n= 541333)[23]。英国生物库是一个人口基数,招募了500000名40 - 69岁的参与者在2006 - 2010,并获得广泛的表型和健康信息,如生物测量,在血液和尿液生物标志物,和生活方式指标(24]。在这项研究中,共有123个snp达到全基因组意义(P< 5×108)并解释了1.1%的方差在白天打盹的频率。23 andme是直接面向消费者基因检测公司。这些123个snp在23 andme复制和验证研究队列(n= 541333),其中94个snp仍23 andme队列中。白天小睡的基因变异复制频率在23 andme人群中,参与者被问到这个问题:“每周多少天你白天小睡吗?(15分钟或更多)”,并选择一个来自以下四个选项:“从不/很少(0或1)”“有时(2 - 5)通常(6、7)”,"Tend not to answer". Since the population of the subsequent GWAS study on schizophrenia may partially overlap with that of the UK Biobank study, the 94 SNPs that were replicated and validated in the 23andMe study cohort were used as IVs in this study for subsequent analyses to avoid the bias of winner's curse caused by the overlapping samples [25]。

基因与精神分裂症关联

精神分裂症汇总统计数据来自一个精神病的GWAS研究基因组联盟(包括)构建的全基因组基因型数据49 ancestry-matched,重叠病例对照样品(34241例和45604控制)和三个家庭欧洲血统样本(1235 parent-affected-offspring三人小组)(26]。GWAS研究确定了128个独立的单核苷酸多态性与精神分裂症相关,其中108遇到了全基因组意义(P< 5×108)。摘要统计信息可在内外加厚OpenGWAS项目数据库(https://gwas.mrcieu.ac.uk/全基因组关联ID)和“ieu-b-42”。

辅助变量的选择

我们提取的单核苷酸多态性,满足全基因组意义从白天小睡的GWAS汇总统计频率和精神分裂症,分别。确保结果的可靠性,我们执行的叮铃声聚集方法严格凝结阈值(r2< 0.001 kb = 10000),以确保snp在剩余连锁不平衡(LD)在一个特定的窗口裁剪评估偏差引起的残余LD的遗传变异。我们计算了F静脉注射的统计,一个F> 10意味着充分分析一般先生(22]。此外,我们选择合适的代理单核苷酸多态性(r2> 0.8)当exposure-associated snp并没有出现在结果汇总统计数据和删除单核苷酸多态性与回文结构分析。

分析了先生

我们应用反变量加权(IVW)方法作为主要分析先生估计白天小睡频率和精神分裂症之间的双向因果关系。评估IVW分析结果的可靠性,我们执行额外的测试水平基因多效性检测异构的结果,包括科克伦的统计测试和先生Egger拦截试验。我们还执行(i)加权平均的方法,它允许单核苷酸多态性与β更重要的贡献可以派生的估计和方差倒数加权每个SNP的贡献的(27];(2)健壮的剖面调整分数(MR-RAPS)先生,先生可以给一个健壮的推理分析弱辅助变量,尤其是当接触和结果都是复杂的特征(28];(3)先生多向性余量和和离群值(MR-PRESSO)测试,这对水平监测和纠正多向性的离群值(29日)和(iv)径向先生,可以改善检测异常值IVW和MR-Egger径向情节的分析(30.之后]敏感性分析。

双向先生两个示例分析,水平基因多效性测试,和敏感性分析TwoSampleMR包(0.5.6版),先生毫无价值的东西(0.2版),径向先生(版本1.0),MR-PRESSO(版本1.0)R程序(R统计计算的基础,版本4.1.2)。

结果

辅助变量的选择和孟德尔随机化分析

选择静脉注射的流程图和先生分析显示在无花果。2。我们提取94和108个snp作为初始静脉注射从白天小睡的GWAS汇总统计频率和精神分裂症,分别。总共有64和77个snp白天小睡频率和精神分裂症后被包含在后续分析先生叮铃声凝结的进步,选择适当的代理单核苷酸多态性和排斥的snp回文结构,分别。科克伦的统计测试显示显著的异质性,先生Egger拦截测试建议水平基因多效性不显著(表1和表2)。离群值的检测径向先生后,我们进行分析与47先生和51个snp(补充表1和表年代2)与白天小睡频率和精神分裂症作为最终接受静脉注射,分别。

图2
图2

孟德尔随机化的流程图。缩写:GWAS,全基因组关联研究;SNP(单核苷酸多态性;LD,连锁不平衡;先生,孟德尔随机化

表1因果估计白天小睡频率对精神分裂症孟德尔随机化。缩写:SNP,单核苷酸多态性;IVW方差倒数加权;MR-RAPS,孟德尔随机化健壮剖面调整分数;MR-PRESSO,孟德尔随机化多向性余量和和离群值
表2因果为精神分裂症在白天小睡频率估计孟德尔随机化。缩写:SNP,单核苷酸多态性;IVW方差倒数加权;MR-RAPS,孟德尔随机化健壮剖面调整分数;MR-PRESSO,孟德尔随机化多向性余量和和离群值

因果关系白天小睡的频率和精神分裂症

F统计所有静脉注射与白天小睡频率和精神分裂症> 10,它有效地避免了弱静脉注射的偏见。IVW方法显示白天小睡频率之间的双向因果关系和精神分裂症的发生(表1和表2),比值比打盹(或)增加1个单位类别(永远,有时,通常)精神分裂症为3.48(95%可信区间[CI]: 1.54 - -7.85,P= 2.65×103;没有异常值:或= 3.38,95%置信区间CI: 2.02 - -5.65,P= 3.58×106)和β为精神分裂症的发生在白天打盹频率为0.0095(95%置信区间:0.0012—-0.0178,P= 2.50×102;没有异常值:β= 0.0112,95%置信区间ci: 0.0060 - -0.0163,P= 2.04×105)。加权中值、MR-RAPS径向先生,MR-PRESSO方法(表得到一致的结论12)。

讨论

精神分裂症是经常被视为最严重的精神疾病之一(2),与病人有比一般人短寿命大约15年和终身自杀风险(5%至10%4]。精神分裂症是一种最禁用所有的疾病在发展中国家和发达国家和与社会连通性下降,就业率低,和受损的独立生活1]。因此,有效的发展策略来防止精神分裂症和减少或避免精神分裂症的危险因素对提高人口健康很重要。我们从GWAS研究和执行验证静脉注射方法加强之间的双向因果推论先生白天小睡频率和精神分裂症。结果显示一个潜在的双向因果关系更频繁的日间小睡和精神分裂症的发生。

精神分裂症是伴随着睡眠异常和与更严重的精神病症状,临床结果(31日]。睡眠异常在精神分裂症患者包括失眠,噩梦,睡眠质量差,等等,并可能导致恶化的精神症状,如幻觉、妄想,和认知障碍32]。最近的研究表明,频繁的疏忽与多个不良结果,包括抑郁症(33),死亡率增加9和认知能力下降33),这意味着白天小睡的方向性和不良结果是很重要的。研究non-hospitalized中年男性和女性的睡眠习惯与精神分裂症,这是表明,白天打盹更频繁的在精神分裂症患者与健康对照组相比,和反映了昼夜节律障碍在精神分裂症患者34]。研究表明,精神分裂症患者在睡眠纺锤体缺陷,而白天小睡可以有效地估计在精神分裂症患者夜间睡眠纺锤体密度(35,36]。我们的研究结果可以提供一个依据白天小睡的干预和治疗精神分裂症。

先生的方法可以有效地减少偏见由于混杂因素和未知的反向因果关系,这很难消除在传统的观察性研究。敏感性分析也提供了一致的结果,提高了鲁棒性和可信度的结论。目前的研究仍有局限性。首先,尽管奥法能够避免“通过多种敏感性分析和控制水平的基因多效性影响,仍有潜在的和未知的混杂因素和水平基因多效性,可能会影响研究的结果。其次,更频繁的白天午睡是一个二进制接触,所以我们无法精确计算GWAS数据经常打盹具体的小时和分钟。第三,我们的研究可能不会有效地扩展到其他人群的暴露GWAS GWAS和结果是选择从欧洲人口,不能扩展到亚洲人口或其他人群。第四,参加英国生物库和23 andme军团是健康的,所以我们的结论不能推广到其他疾病患者。最后,目前有几个独立的随机对照试验更频繁的白天小睡和精神分裂症;结果需要在未来的临床试验进行验证。

结论

这种双向的两个示例孟德尔随机化研究的结果提出了一个双向因果关系更频繁的日间小睡精神分裂症的发生,这意味着白天小睡频率是一个潜在的干预的进展和治疗精神分裂症。

可用性的数据和材料

生成的数据集和分析在当前的研究中白天小睡遗传因素对代谢疾病,影响健康(包括其补充信息文件,https://doi.org/10.1038/s41467 - 020 - 20585 - 3),在内外加厚OpenGWAS项目数据库(https://gwas.mrcieu.ac.uk/和精神基因研究团https://www.med.unc.edu/pgc/]。

缩写

先生:

孟德尔随机化

GWAS:

全基因组关联研究

SNP:

单核苷酸多态性

四:

工具变量

包括:

精神病基因研究团

LD:

连锁不平衡

或者:

优势比

置信区间:

置信区间

IVW:

方差倒数加权

MR-RAPS:

孟德尔随机化的调整配置文件的分数

MR-PRESSO:

孟德尔随机化多向性余量和和离群值

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下载参考

确认

特别感谢哈桑s Dashti博士等人的贡献的原始数据和分析,对内外加厚OpenGWAS项目数据库(https://gwas.mrcieu.ac.uk/),而精神基因组学协会(https://www.med.unc.edu/pgc/提供了数据。

资金

不适用。

作者信息

作者和联系

作者

贡献

JM YW概念化和设计研究,JM的主要贡献在于写作手稿,CJ, YY, LH收集数据并进行分析。所有作者阅读和批准最终的手稿。

相应的作者

对应到易王

道德声明

伦理批准和同意参与

总结了本研究中使用的所有数据源的数据相关的GWAS研究和内外加厚OpenGWAS项目数据库,这是公开的免费下载,不需要审查机构的批准。

同意出版

不适用。

相互竞争的利益

作者宣称没有利益冲突。

额外的信息

出版商的注意

施普林格自然保持中立在发表关于司法主权地图和所属机构。

补充信息

额外的文件1:

表S1表S2

权利和权限

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妈,J。,Jin, C., Yang, Y.et al。白天小睡协会频率和精神分裂症:双向两个示例孟德尔随机化研究。manbetx安卓app22786 (2022)。https://doi.org/10.1186/s12888 - 022 - 04431 - y

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关键字

  • 孟德尔随机化
  • 白天打盹
  • 精神分裂症
  • 单核苷酸多态性
  • 全基因组关联研究
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